Estas verrugas varían en apariencia entre las del varón y las de la mujer:
Mujer: blandas. De color gris o rosa, pedunculadas y suelen encontrarse en racimos. Las zonas más afectadas son la vulva, la pared vaginal y el periné.
Varón: blandas. Las presentes en el pene suelen ser lisas y papilares. Mientras que las del periné asemejan a una coliflor. A menudo, aparecen primero en el prepucio (tejido que cubre el pene) y el glande, y luego en el escroto (tejido que envuelve a los testículos) y la región perianal.
Algunos hombres y mujeres desarrollarán una irritación en la piel que parecen granitos sin pus (que se conoce como "ojo de pescado") visibles en el área genital. Estas son verrugas genitales visibles.
Algunos hombres y mujeres tienen cambios pequeños en la piel que no se pueden ver a simple vista. Esto se llama HPV subclínico. Los especialistas pueden encontrar éstos mirando la piel con instrumentos especiales que amplifican (hace que se vea más grande) el área.
Algunas mujeres tienen cambios anormales en las células de su cérvix.